در اوایل قرن 17، ژاپن سیاست‌های سختگیرانه‌ای در زمینه انزوا اتخاذ کرد و تقریباً تمام ارتباطات خود با کشورهای خارجی را قطع کرد. در سال 1853، ناوگان ایالات متحده تحت فرماندهی دریاسالار پری درب‌های کشور را به‌زور باز کرد و باعث مدرن شدن سیستم‌های اجتماعی و سیاسی کشور و در نهایت سقوط شوگونات شد. تاریخ چنین می‌گوید، اما در گینتاما، اینطور نیست. به‌جای ناوگان ایالات متحده، کشور توسط سفینه‌های فضایی از چهار گوشه جهان مورد حمله قرار می‌گیرد و به زودی شاهد اشغال آن توسط بیگانگان فضایی خواهیم بود. شوگونات به یک عروسک در دستان ارتش‌های اشغالگر بیگانه تبدیل شده است. همه سامورایی‌ها خلع سلاح شده‌اند و به کارگران موقت بدون مهارت تبدیل شده‌اند که فقط سعی دارند روزگار خود را بگذرانند. گینتاما داستان یک دستیار به نام گینتکی است، یک سامورایی که هیچ احترامی برای قوانین تعیین‌شده توسط اشغالگران ندارد و آماده است هر کاری برای زنده ماندن انجام دهد. او و گروهش، با این حال، جزء معدود کسانی هستند که اخلاق یک شمشیرباز را فراموش نکرده‌اند. هرکجا که می‌روند، تمام کاری که انجام می‌دهند ایجاد مشکلات است. مشکلاتی که البته سعی می‌کنند حل کنند، اما در واقعیت...

سال‌ها پیش، در روستای مخفی کونوها، یک روباه شیطانی بزرگ زندگی می‌کرد. زمانی که یکی از دُم‌هایش را تکان می‌داد، یک سونامی ایجاد می‌شد. چهارمین هوکاگه این روباه شیطانی را درون یک پسر محبوس کرد تا جان خودش را فدای روستا کند. ناروتو همان پسر است که بدون خانواده بزرگ شد و مردم روستا او را به خاطر فکر کردن به اینکه خود روباه شیطانی است، نفرت داشتند. رویای ناروتو این است که هوکاگه شود و مردم روستا او را به عنوان یک قهرمان بپذیرند.

دانش‌آموز دبیرستانی، ایچیگو کوروساکی، مانند هر کودک عادی نیست. چرا؟ چون او می‌تواند ارواح را ببیند. از کودکی، او قادر به دیدن ارواح از دنیای پس از مرگ بوده است. زندگی ایچیگو زمانی کاملاً تغییر می‌کند که او و دو خواهرش توسط یک روح شیطانی و گرسنه به نام هالو مورد حمله قرار می‌گیرند. درست در لحظه‌ای که همه چیز به نظر از دست رفته می‌آید، ایچیگو و خواهرانش توسط یک شینیگامی (خدای مرگ) به نام کوچیکی روکیا کمک می‌شوند. مسئولیت روکیا این است که ارواح خوب (پلاس‌ها) را به دنیای پس از مرگ به نام سوشی‌یِتی (جامعه ارواح) بفرستد و هالوها را پاکسازی و به سوشی‌یِتی بفرستد. اما در جریان مبارزه با هالو، روکیا آسیب می‌بیند و باید قدرت‌های خود را به ایچیگو منتقل کند. با این قدرت جدید، تمرینات و وظیفه ایچیگو به عنوان یک شینیگامی برای حفظ تعادل بین دنیای زنده‌ها و دنیای مردگان آغاز می‌شود.

آستا و یونُو در همان کلیسا رها شده بودند و از آن زمان تا به حال از هم جدا نشده‌اند. آن‌ها در کودکی قول دادند که با یکدیگر رقابت کنند تا ببینند کدام یک به پادشاه جادوگران بعدی تبدیل خواهد شد. اما وقتی بزرگ‌تر شدند، تفاوت‌های توانایی‌هایشان به طور قابل توجهی مشخص شد. یونُو در کنترل و قدرت جادوی خود نابغه بود، در حالی که آستا هیچ جادویی نداشت و برای جبران کمبود جادوی خود، بدنی فیزیکی را تمرین می‌کرد. در سن ۱۵ سالگی، آن‌ها گریمورهای خود را دریافت کردند؛ یونُو به طور غیرمنتظره‌ای گریموری با نماد چهار برگ شاه بلوط دریافت کرد، در حالی که آستا حتی گریموری هم دریافت نکرد. اما وقتی یونُو تهدید شد، حقیقت قدرت آستا آشکار شد و او گریمور پنج برگ شاه بلوط، یک "شاه بلوط سیاه" دریافت کرد. حالا این دو دوست به سوی هدف یکسان خود راهی می‌شوند.